Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Scamp5Q9JKD3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Scamp5Q9JKD3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms