Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ap3m1Q9JKC8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ap3m1Q9JKC8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Ap3m1Q9JKC8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ap3m1Q9JKC8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ap3m1Q9JKC8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ap3m1Q9JKC8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Ap3m1Q9JKC8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ap3m1Q9JKC8 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms