Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJJ7

Porcn, Protein-serine O-palmitoleoyltransferase porcupine, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PorcnQ9JJJ7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
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PorcnQ9JJJ7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PorcnQ9JJJ7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PorcnQ9JJJ7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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PorcnQ9JJJ7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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PorcnQ9JJJ7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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PorcnQ9JJJ7 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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PorcnQ9JJJ7 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PorcnQ9JJJ7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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