Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc86Q9JJ89 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc86Q9JJ89 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms