Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpf2Q9JJ80 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms