Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS8

Slc12a4, Solute carrier family 12 member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc12a4Q9JIS8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slc12a4Q9JIS8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms