Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI57

Gtf2ird1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird1Q9JI57 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gtf2ird1Q9JI57 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms