Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tcirg1Q9JHF5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tcirg1Q9JHF5 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms