Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Cldn12Q9ET43 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cldn12Q9ET43 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cldn12Q9ET43 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Cldn12Q9ET43 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Cldn12Q9ET43 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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