Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
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OtofQ9ESF1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
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OtofQ9ESF1 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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OtofQ9ESF1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
OtofQ9ESF1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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OtofQ9ESF1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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OtofQ9ESF1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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OtofQ9ESF1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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OtofQ9ESF1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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OtofQ9ESF1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
OtofQ9ESF1 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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