Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vmn1r44Q9EQ47 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms