Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SgshQ9EQ08 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms