Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clstn1Q9EPL2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clstn1Q9EPL2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms