Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Trmt112Q9DCG9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Trmt112Q9DCG9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms