Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Xab2Q9DCD2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Xab2Q9DCD2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms