Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Csnk1dQ9DC28 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Csnk1dQ9DC28 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms