Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc97Q9DBT3 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc97Q9DBT3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms