Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Ftsj3Q9DBE9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ftsj3Q9DBE9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms