Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Smg9Q9DB90 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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Smg9Q9DB90 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg9Q9DB90 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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