Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rsph3bQ9DA80 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms