Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc89Q9DA73 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms