Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Rnf138rt1Q9D9M9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnf138rt1Q9D9M9 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms