Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ifrd2Q9D8U0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms