Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Q9D8L0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Q9D8L0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms