Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Slx4ipQ9D7Y9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Slx4ipQ9D7Y9 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms