Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Chmp4cQ9D7F7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms