Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gbe1Q9D6Y9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms