Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc39Q9D5Y1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc39Q9D5Y1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms