Protein–RNA interactions for Protein: Q9D554

Sf3a3, Splicing factor 3A subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a3Q9D554 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3a3Q9D554 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sf3a3Q9D554 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms