Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rabl3Q9D4V7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms