Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Lonrf3Q9D4H7 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms