Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cfap53Q9D439 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cfap53Q9D439 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms