Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9D2Q3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9D2Q3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms