Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2J4

Vsig1, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig1Q9D2J4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vsig1Q9D2J4 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Vsig1Q9D2J4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms