Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Tspan11Q9D1D1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms