Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0M0

Exosc7, Exosome complex exonuclease RRP42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc7Q9D0M0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Exosc7Q9D0M0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.8 ms