Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW6

Rnf146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf146Q9CZW6 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf146Q9CZW6 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rnf146Q9CZW6 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms