Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Shisa9Q9CZN4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms