Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZB3

Thumpd2, THUMP domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd2Q9CZB3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Thumpd2Q9CZB3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Thumpd2Q9CZB3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms