Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ04

Cops7a, COP9 signalosome complex subunit 7a, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7aQ9CZ04 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cops7aQ9CZ04 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cops7aQ9CZ04 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cops7aQ9CZ04 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Cops7aQ9CZ04 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cops7aQ9CZ04 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Cops7aQ9CZ04 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cops7aQ9CZ04 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Cops7aQ9CZ04 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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