Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX13

Cnih4, Protein cornichon homolog 4, mousemouse

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih4Q9CX13 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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Cnih4Q9CX13 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cnih4Q9CX13 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Cnih4Q9CX13 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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