Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Utp23Q9CX11 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms