Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cxxc1Q9CWW7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cxxc1Q9CWW7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms