Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Khdc3Q9CWU5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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