Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tdrd12Q9CWU0 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tdrd12Q9CWU0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms