Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWN7

Cnot11, CCR4-NOT transcription complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot11Q9CWN7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Cnot11Q9CWN7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Cnot11Q9CWN7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms