Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUU3

Sycp2, Synaptonemal complex protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp2Q9CUU3 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Sycp2Q9CUU3 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Sycp2Q9CUU3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms