Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm18515-201ENSMUST00000219755 797 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Fcf1Q9CTH6 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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