Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PclafQ9CQX4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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