Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

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Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ykt6Q9CQW1 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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